Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms