Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms