Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms