Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NXPE4Q6UWF7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms