Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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