Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC174Q6PII3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms