Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM88Q6PEY1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM88Q6PEY1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms