Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD3Q6PCD5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms