Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms