Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMBQ6PCB8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms