Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms