Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN1Q6NZI2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms