Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP2

FAM71F2, Protein FAM71F2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F2Q6NXP2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM71F2Q6NXP2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM71F2Q6NXP2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM71F2Q6NXP2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM71F2Q6NXP2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM71F2Q6NXP2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM71F2Q6NXP2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM71F2Q6NXP2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM71F2Q6NXP2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM71F2Q6NXP2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM71F2Q6NXP2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM71F2Q6NXP2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM71F2Q6NXP2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM71F2Q6NXP2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM71F2Q6NXP2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM71F2Q6NXP2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM71F2Q6NXP2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM71F2Q6NXP2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM71F2Q6NXP2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM71F2Q6NXP2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms