Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HMBOX1Q6NT76 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HMBOX1Q6NT76 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HMBOX1Q6NT76 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HMBOX1Q6NT76 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HMBOX1Q6NT76 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMBOX1Q6NT76 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMBOX1Q6NT76 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMBOX1Q6NT76 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMBOX1Q6NT76 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMBOX1Q6NT76 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMBOX1Q6NT76 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMBOX1Q6NT76 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMBOX1Q6NT76 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMBOX1Q6NT76 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms