Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM68Q6AZZ1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms