Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3Q658K8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms