Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms