Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHEQ5VZ18 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHEQ5VZ18 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms