Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms