Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GFI1BQ5VTD9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFI1BQ5VTD9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms