Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms