Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA31

RNF187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF187Q5TA31 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF187Q5TA31 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms