Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
BEND3Q5T5X7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms