Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms