Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A1Q5RGS3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms