Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C9orf116Q5BN46 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C9orf116Q5BN46 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C9orf116Q5BN46 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf116Q5BN46 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf116Q5BN46 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf116Q5BN46 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf116Q5BN46 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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