Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC178Q5BJE1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms