Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC44A4Q53GD3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A4Q53GD3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms