Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms