Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C5orf22Q49AR2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms