Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9L4

C15orf59, UPF0583 protein C15orf59, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf59Q2T9L4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C15orf59Q2T9L4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C15orf59Q2T9L4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms