Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms