Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NREPQ16612 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NREPQ16612 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NREPQ16612 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NREPQ16612 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NREPQ16612 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NREPQ16612 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NREPQ16612 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NREPQ16612 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NREPQ16612 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NREPQ16612 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NREPQ16612 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NREPQ16612 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NREPQ16612 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NREPQ16612 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NREPQ16612 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NREPQ16612 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NREPQ16612 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NREPQ16612 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NREPQ16612 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NREPQ16612 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NREPQ16612 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NREPQ16612 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NREPQ16612 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NREPQ16612 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NREPQ16612 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NREPQ16612 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NREPQ16612 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NREPQ16612 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NREPQ16612 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NREPQ16612 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NREPQ16612 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NREPQ16612 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NREPQ16612 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NREPQ16612 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NREPQ16612 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms