Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms