Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PKN1Q16512 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
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