Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGA3Q16281 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
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CNGA3Q16281 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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