Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
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