Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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