Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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VAMP3Q15836 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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VAMP3Q15836 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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