Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNA6Q15825 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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