Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A5Q15758 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A5Q15758 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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