Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF1Q15637 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF1Q15637 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SF1Q15637 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF1Q15637 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF1Q15637 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF1Q15637 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF1Q15637 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF1Q15637 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF1Q15637 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF1Q15637 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SF1Q15637 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF1Q15637 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF1Q15637 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF1Q15637 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF1Q15637 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF1Q15637 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF1Q15637 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SF1Q15637 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF1Q15637 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF1Q15637 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF1Q15637 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF1Q15637 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF1Q15637 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF1Q15637 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF1Q15637 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF1Q15637 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SF1Q15637 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF1Q15637 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF1Q15637 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF1Q15637 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF1Q15637 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF1Q15637 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SF1Q15637 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF1Q15637 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF1Q15637 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF1Q15637 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF1Q15637 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF1Q15637 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF1Q15637 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF1Q15637 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF1Q15637 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF1Q15637 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF1Q15637 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF1Q15637 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SF1Q15637 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF1Q15637 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF1Q15637 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF1Q15637 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF1Q15637 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF1Q15637 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF1Q15637 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF1Q15637 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF1Q15637 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF1Q15637 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF1Q15637 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF1Q15637 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF1Q15637 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF1Q15637 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF1Q15637 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF1Q15637 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF1Q15637 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF1Q15637 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF1Q15637 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF1Q15637 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF1Q15637 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF1Q15637 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF1Q15637 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF1Q15637 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF1Q15637 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF1Q15637 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF1Q15637 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SF1Q15637 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF1Q15637 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF1Q15637 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF1Q15637 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF1Q15637 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF1Q15637 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF1Q15637 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF1Q15637 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF1Q15637 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SF1Q15637 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SF1Q15637 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF1Q15637 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF1Q15637 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF1Q15637 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF1Q15637 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF1Q15637 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF1Q15637 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF1Q15637 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF1Q15637 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF1Q15637 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF1Q15637 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF1Q15637 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF1Q15637 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SF1Q15637 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF1Q15637 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF1Q15637 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF1Q15637 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF1Q15637 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms