Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRADDQ15628 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms