Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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