Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCLAFQ15004 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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