Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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