Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms