Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDCD11Q14690 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms