Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL4A6Q14031 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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