Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CDK13Q14004 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CDK13Q14004 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
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