Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX39BQ13838 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX39BQ13838 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX39BQ13838 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX39BQ13838 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX39BQ13838 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX39BQ13838 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX39BQ13838 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX39BQ13838 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX39BQ13838 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DDX39BQ13838 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX39BQ13838 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX39BQ13838 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX39BQ13838 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX39BQ13838 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX39BQ13838 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX39BQ13838 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX39BQ13838 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX39BQ13838 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX39BQ13838 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX39BQ13838 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX39BQ13838 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DDX39BQ13838 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DDX39BQ13838 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDX39BQ13838 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDX39BQ13838 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDX39BQ13838 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DDX39BQ13838 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDX39BQ13838 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DDX39BQ13838 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DDX39BQ13838 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDX39BQ13838 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DDX39BQ13838 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DDX39BQ13838 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DDX39BQ13838 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDX39BQ13838 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DDX39BQ13838 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
DDX39BQ13838 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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